دوره 12، شماره 1 - ( زمستان 1401 )
جلد 12 شماره 1 صفحات 84-77 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
khosravi F, Mohamadynejad P, moghanibashi M. Association of VNTR Polymorphism of NLRP3 Gene With the Risk of Gastric Cancer. aumj 2022; 12 (1) :77-84
URL: http://aums.abzums.ac.ir/article-1-1626-fa.html
URL: http://aums.abzums.ac.ir/article-1-1626-fa.html
خسروی فایز، محمدی نژاد پریسا، مغنی باشی محمد مهدی. ارتباط چندشکلی VNTR ژن NLRP3 با خطر ابتلا به سرطان معده. نشریه علمی پژوهشی دانشگاه علوم پزشکی البرز. 1401; 12 (1) :77-84
1- کارشناسی ارشد،گروه زیست شناسی،دانشکده علوم پایه، واحد شهرکرد،دانشگاه آزاد اسلامی،شهرکرد، ایران
2- استادیار،گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، واحد شهرکرد،دانشگاه آزاد اسلامی، شهرکرد، ایران
3- استادیار ، گروه ژنتیک،دانشکده پزشکی، واحد کازرون، دانشگاه آزاد اسلامی،کازرون، ایران
2- استادیار،گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، واحد شهرکرد،دانشگاه آزاد اسلامی، شهرکرد، ایران
3- استادیار ، گروه ژنتیک،دانشکده پزشکی، واحد کازرون، دانشگاه آزاد اسلامی،کازرون، ایران
چکیده: (1128 مشاهده)
زمینه و هدف: سرطان معده یکی از سرطان‌های شایع در سراسرجهان از جمله ایران می‌باشد که مرگ ومیر بالایی دارد. یکی از عوامل موثر در ابتلا به سرطان معده، التهاب ناشی از افزایش عملکرد پروتئین Cryopyrin است که در انسان توسط ژن NLRP3 کد می‌شود. افزایش بیان این ژن منجر به تولید سایتوکاین های IL-1β و IL-18 شده و التهاب را افزایش میدهد. با توجه به نقش مهم ژن NLRP3، در این مطالعه نقش چندشکلی VNTR در اینترون 4 ژن NLRP3 در استعداد ابتلا به سرطان معده بررسی شد.
مواد و روشها: در این مطالعه چندشکلی VNTR ژن NLRP3 در ۱۰۰ فرد مبتلا به سرطان معده و 88 فرد سالم با تکنیکPCR تعیین ژنوتیپ گردید. داده‌های به‌دست‌آمده با نرم‌افزار SPSS ν21 و آزمون رگرسیون لجستیک آنالیز شدند.
یافتهها: در این مطالعه ۱۵ نوع ژنوتیپ مختلف و 7 نوع آلل در پلی‌مورفیسم VNTR ژن NLRP3 شناسایی شد که آلل 12 تکرار و ژنوتیپ 12/12 بیشترین فراوانی را به خود اختصاص داد. همچنین برای اولین بار آلل 14 تکرار شناسایی گردید. آنالیز نتایج نشان داد که ژنوتیپ 12/12 در مقایسه با سایر ژنوتیپ خطر ابتلا به سرطان معده را افزایش میدهد ) 01/0 p value=، 76/0 - 14/0 CI=، 32/0(OR=.
نتیجه: به نظر می‌رسد ژنوتیپ 12/12 در اینترون 4 ژن NLRP3 خطر ابتلا به سرطان معده را افزایش میدهد.
مواد و روشها: در این مطالعه چندشکلی VNTR ژن NLRP3 در ۱۰۰ فرد مبتلا به سرطان معده و 88 فرد سالم با تکنیکPCR تعیین ژنوتیپ گردید. داده‌های به‌دست‌آمده با نرم‌افزار SPSS ν21 و آزمون رگرسیون لجستیک آنالیز شدند.
یافتهها: در این مطالعه ۱۵ نوع ژنوتیپ مختلف و 7 نوع آلل در پلی‌مورفیسم VNTR ژن NLRP3 شناسایی شد که آلل 12 تکرار و ژنوتیپ 12/12 بیشترین فراوانی را به خود اختصاص داد. همچنین برای اولین بار آلل 14 تکرار شناسایی گردید. آنالیز نتایج نشان داد که ژنوتیپ 12/12 در مقایسه با سایر ژنوتیپ خطر ابتلا به سرطان معده را افزایش میدهد ) 01/0 p value=، 76/0 - 14/0 CI=، 32/0(OR=.
نتیجه: به نظر می‌رسد ژنوتیپ 12/12 در اینترون 4 ژن NLRP3 خطر ابتلا به سرطان معده را افزایش میدهد.
فهرست منابع
1. Malekzadeh R.Gastric Cancer in Iran: Epidemology and Risk Factors. Arch Iran Med. 2009; 12(6):576-583.
2. Inoue M, Tsugane S. Epidemiology of gastric cancer in Japan. Postgrad Med J. 2005; 81 (957): 419-24. [DOI:10.1136/pgmj.2004.029330]
3. Lichtenstein P, Holm NV, Verkasalo PK, Iliadou A, Kaprio J, Koskenvuo M, et al. Environmental and heritable factors in the causation of cancer-analyses of cohorts of twins from Sweden, Denmark, and Finland. N Engl J Med 2000; 343. [DOI:10.1056/NEJM200007133430201]
4. Zendehdel K,Marzban M,Nahvijou A,Jafari N,Six-fold Difference in the stomatch Mortality Rate between Northern and Southern Iran
5. Kwon SJ. Evaluation of the 7th UICC TNM Staging System of Gastric Cancer. J Gastric Cancer 2011; 11 (2): 78-85. [DOI:10.5230/jgc.2011.11.2.78]
6. kim BC, Kim WY,SNP@Promoter:a database of human SNPS Within the putative promoter regions. BMC Bioinformatics.2008.12-57
7. Örd T, Puurand T, Örd D, Annilo T, Möls M, Remm M, et al. A human-specific VNTR in the TRIB3 promoter causes gene expression variation between individuals. PLoS genetics. 2020;16(8):e1008981. [DOI:10.1371/journal.pgen.1008981]
8. Ghavidel M, Mansury D, Nourian K, Ghazvini K. The most common spoligotype of Mycobacterium bovis isolated in the world and the recommended loci for VNTR typing; A systematic review. Microbial pathogenesis 2018 ;118:310-5. [DOI:10.1016/j.micpath.2018.03.036]
9. Hoffman HM, Mueller JL, Broide DH, Wanderer AA, Kolodner RD. Mutation of a new gene encoding a putative pyrin-like protein causes familial cold autoinflammatory syndrome and Muckle-Wells syndrome. Nat Genet 2001; 29:301-5. [DOI:10.1038/ng756]
10. Mathews RJ, Sprakes MB, McDermott MF. NOD-like receptors and inflammation. Arthritis Res Ther 2009; 10(6):228. [DOI:10.1186/ar2525]
11. Chi-Jung Chung, Bo-Ying Bao, Polymorphism of nucleotide binding domain-like receptor protein 3 (NLRP3) increases susceptibility of total urinary arsenic to renal cell carcinoma. 2020 Apr 20; 10(1):6640. [DOI:10.1038/s41598-020-63469-8]
12. Toshinori Omi, Maki Kumada, An intronic variable number of tandem repeat polymorphisms of the cold-induced autoinflammatory syndrome 1 (CIAS1) gene modifies gene expression and is associated with essential hypertension. 2006 Dec;14(12):1295-305. [DOI:10.1038/sj.ejhg.5201698]
13. Allen I.C., TeKippe E., Woodford R.M.T., Uronis J.M., Holl E.K, Rogers A.B, et al. The NLRP3 inflammasome functions as a negative regulator of tumorigenesis during colitis-associated cancer. J Exp Med. 2010; 207(5):1045-56. [DOI:10.1084/jem.20100050]
14. Moossavi M., Parsamanesh N., Bahrami A., Atkin S.L., Sahebkar A. Role of the NLRP3 inflammasome in cancer. Mol Cancer 2018; 17(1):158. [DOI:10.1186/s12943-018-0900-3]
15. Lee, H.E., Lee, J.Y., Yang, G. et al. Inhibition of NLRP3 inflammasome in tumor microenvironment leads to suppression of metastatic potential of cancer cells. Sci Rep 2019; 9:12277. [DOI:10.1038/s41598-019-48794-x]
16. Li L, Hong Z. IL-1β/NF-kb signaling promotes colorectal cancer cell growth through miR-181a/PTEN axis. Arch Biochem Biophys. 2016; 604:20-6. [DOI:10.1016/j.abb.2016.06.001]
17. S Li 1, X Liang 1, L Ma 1, L Shen 1, T Li 1, L Zheng 1, et al.MiR-22 sustains NLRP3 expression and attenuates H. pylori-induced gastric carcinogenesis. Oncogene 2018; 37(7):884-896. [DOI:10.1038/onc.2017.381]
18. M Jaeger, A Carvalho , Association of a variable number tandem repeat in the NLRP3 gene in women with susceptibility to RVVC. 2016; 35(5):797-801. [DOI:10.1007/s10096-016-2600-5]
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
