[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
بخش‌های اصلی
اطلاعات نشریه::
آرشیو مجله و مقالات::
برای نویسندگان::
برای داوران::
ثبت نام و اشتراک::
تماس با ما::
تسهیلات پایگاه::
نمایه ها::
::
جستجو در پایگاه

جستجوی پیشرفته
..
دریافت اطلاعات پایگاه
نشانی پست الکترونیک خود را برای دریافت اطلاعات و اخبار پایگاه، در کادر زیر وارد کنید.
..
ثبت شده در

AWT IMAGE

AWT IMAGE

..
:: دوره 13، شماره 1 - ( زمستان 1402 ) ::
جلد 13 شماره 1 صفحات 70-63 برگشت به فهرست نسخه ها
مروری بر پروژه فیزیوم؛ دیدگاهی با تمرکز بر مطالعات میان‌رشته‌ای در علوم پزشکی
رهام مظلوم ، غلامرضا بیات ، آزاده خلیلی ، محسن اعرابی
استادیار فیزیولوژی، گروه فیزیولوژی-فارماکولوژی-فیزیک پزشکی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی البرز، کرج، ایران
چکیده:   (63 مشاهده)
مفهوم پروژه فیزیوم برای ارائه توصیف کمی از پویایی فیزیولوژیکی و رفتار عملکردی موجود زنده سالم به عنوان یک کل ارائه شده است. بدن انسان سیستمی پیچیده است و این پیچیدگی در همه اجزا از ژن­ها تا محیط، شیوه زندگی و سالخوردگی وجود دارد. هدف نهایی پروژه فیزیوم ایجاد یک "انسان فیزیولوژیک مجازی" به کمک سر هم نمودن مدل­های محاسباتی و کامپیوتری قابل اعتماد و پیشرفته است تا بتواند با دیدگاه کل­نگر و با کمک تئوری سیستم ها، در شرایط آزمایشگاهی و درمانی مورد بررسی و ارزیابی قرار گیرد. این روند از طریق ایجاد مدل سازی در سطوح مولکولی و سلولی آغاز شده و با به هم پیوستن اجزای آن و به کمک واقعیت مجازی، به عنوان یک کل مرتبط در نظر گرفته خواهد شد تا انسان فیزیولوژیک مجازی شکل گیرد. برای رسیدن به این هدف در پروژه فیزیوم از شاخه­های دیگر دانش در کنار علوم پزشکی به صورت همکاری بین رشته­ای استفاده می­شود. اگرچه این پروژه تا به امروز دارای فراز و نشیب های مختلفی بوده ولی به طور کلی در به کار گیری علوم مختلف در کنار هم پیشرفت قابل قبولی داشته است و به همین علت به نظر می­رسد می­توان از روند این پروژه برای ایجاد یک الگوی مناسب در شکل گیری مطالعات میان­رشته ای استفاده نمود.
واژه‌های کلیدی: فیزیولوژی، واقعیت مجازی، تئوری سیستم­ ها، مدل­ های محاسباتی
متن کامل [PDF 322 kb]   (37 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: تخصصي
دریافت: 1401/5/30 | پذیرش: 1401/8/28 | انتشار: 1402/12/10
فهرست منابع
1. Kivits J, Ricci L, Minary L. Interdisciplinary research in public health: the 'why'and the 'how'. BMJ Publishing Group Ltd; 2019. p. 1061-2.
2. Bassingthwaighte JB. Strategies for the physiome project. Annals of biomedical engineering 2000;28(8):1043-58. [DOI:10.1114/1.1313771]
3. Coveney PV, Diaz V, Hunter P, Kohl P, Viceconti M. The virtual physiological human. The Royal Society; 2011. p. 281-5.
4. Hunter PJ, Crampin EJ, Nielsen PM. Bioinformatics, multiscale modeling and the IUPS Physiome Project. Briefings in bioinformatics 2008;9(4):333-43. [DOI:10.1093/bib/bbn024]
5. Hunter P, Robbins P, Noble D. The IUPS human physiome project. Pflügers Archiv. 2002;445(1):1-9. [DOI:10.1007/s00424-002-0890-1]
6. Hunter P, Smith N, Fernandez J, Tawhai M. Integration from proteins to organs: the IUPS Physiome Project. Mechanisms of ageing and development 2005;126(1):187-92. [DOI:10.1016/j.mad.2004.09.025]
7. Crampin EJ, Halstead M, Hunter P, Nielsen P, Noble D, Smith N, et al. Computational physiology and the physiome project. Experimental Physiology 2004;89(1):1-26. [DOI:10.1113/expphysiol.2003.026740]
8. Rajagopal V, Arumugam S, Hunter PJ, Khadangi A, Chung J, Pan M. The Cell Physiome: What Do We Need in a Computational Physiology Framework for Predicting Single-Cell Biology? Annu Rev Biomed Data Sci. 2022;5:341-66.
9. Mazloom R. Evidence of the Physiologic Functions of the Gastrointestinal Tract as a Complex System. Foundations of Science 2021;26(2):257-74. [DOI:10.1007/s10699-020-09656-2]
10. Bassingthwaighte J, Hunter P, Noble D. The Cardiac Physiome: perspectives for the future. Experimental physiology 2009;94(5):597-605. [DOI:10.1113/expphysiol.2008.044099]
11. Kofránek J, Kripner T, Andrlík M, Mašek J, editors. Creative connection between multimedia, simulation and software development tools in the design and development of biomedical educational simulators. Simulation Interoperability Workshop, Position papers; 2003.
12. Parodi VA. The Digital Patient: Changing the Paradigm of Healthcare and Impacting Medical Research and Education. The Digital Patient: Advancing Healthcare, Research, and Education 2016:273-88.
13. Garny A, Cooper J, Hunter PJ. Toward a VPH/physiome toolkit. Wiley Interdisciplinary Reviews: Systems Biology and Medicine 2010;2(2):134-47. [DOI:10.1002/wsbm.63]
14. Hunter P, Nielsen P. A strategy for integrative computational physiology. Physiology 2005;20(5):316-25. [DOI:10.1152/physiol.00022.2005]
15. Hunter P. The Virtual Physiological Human: The Physiome Project Aims to Develop Reproducible, Multiscale Models for Clinical Practice. IEEE Pulse 2016;7(4):36-42. [DOI:10.1109/MPUL.2016.2563841]
16. Bradley C, Bowery A, Britten R, Budelmann V, Camara O, Christie R, et al. OpenCMISS: a multi-physics & multi-scale computational infrastructure for the VPH/Physiome project. Progress in biophysics and molecular biology 2011;107(1):32-47. [DOI:10.1016/j.pbiomolbio.2011.06.015]
17. Cooling MT, Nickerson DP, Nielsen PM, Hunter PJ. Modular modelling with Physiome standards. The Journal of physiology 2016;594(23):6817-31. [DOI:10.1113/JP272633]
18. Garny A, Nickerson DP, Cooper J, Santos RWd, Miller AK, McKeever S, et al. CellML and associated tools and techniques. Philosophical transactions of the Royal Society A: Mathematical, physical and engineering sciences 2008;366(1878):3017-43. [DOI:10.1098/rsta.2008.0094]
19. Clerx M, Cooling MT, Cooper J, Garny A, Moyle K, Nickerson DP, et al. CellML 2.0. J Integr Bioinform. 2020;17(2-3).
20. Hunter P. The IUPS Physiome Project: a framework for computational physiology. Progress in biophysics and molecular biology 2004;85(2-3):551-69.
21. Mirams GR, Pathmanathan P, Gray RA, Challenor P, Clayton RH. Uncertainty and variability in computational and mathematical models of cardiac physiology. The Journal of physiology 2016;594(23):6833-47. [DOI:10.1113/JP271671]
22. Hunter PJ, Smith NP. The cardiac physiome project. The Journal of Physiology 2016;594(23):6815. [DOI:10.1113/JP273415]
23. Hill AP, Perry MD, Abi-Gerges N, Couderc JP, Fermini B, Hancox JC, et al. Computational cardiology and risk stratification for sudden cardiac death: one of the grand challenges for cardiology in the 21st century. J Physiol. 2016;594(23):6893-908. [DOI:10.1113/JP272015]
24. Randall Thomas S. Kidney modeling and systems physiology. Wiley Interdisciplinary Reviews: Systems Biology and Medicine 2009;1(2):172-90. [DOI:10.1002/wsbm.14]
25. Nickerson DP, Terkildsen JR, Hamilton KL, Hunter PJ. A tool for multi-scale modelling of the renal nephron. Interface Focus 2011;1(3):417-25. [DOI:10.1098/rsfs.2010.0032]
26. Viceconti M, Hunter P. The Virtual Physiological Human: Ten Years After. Annu Rev Biomed Eng. 2016;18:103-23. [DOI:10.1146/annurev-bioeng-110915-114742]
27. Yu T, Lloyd CM, Nickerson DP, Cooling MT, Miller AK, Garny A, et al. The Physiome Model Repository 2. Bioinformatics 2011;27(5):743-4. [DOI:10.1093/bioinformatics/btq723]
28. Fernandez J, Sartori M, Lloyd D, Munro J, Shim V. Bone remodelling in the natural acetabulum is influenced by muscle force-induced bone stress. Int J Numer Method Biomed Eng. 2014;30(1):28-41. [DOI:10.1002/cnm.2586]
29. Fernandez JW, Shim VB, Hunter PJ. Integrating degenerative mechanisms in bone and cartilage: a multiscale approach. Annu Int Conf IEEE Eng Med Biol Soc. 2012;2012:6616-9. [DOI:10.1109/EMBC.2012.6347511]
30. Shim VB, Hunter PJ, Pivonka P, Fernandez JW. A multiscale framework based on the physiome markup languages for exploring the initiation of osteoarthritis at the bone-cartilage interface. IEEE Trans Biomed Eng. 2011;58(12):3532-6. [DOI:10.1109/TBME.2011.2165955]
31. Cheng L, Du P, O'Grady G. Mapping and modeling gastrointestinal bioelectricity: from engineering bench to bedside. Physiology 2013;28(5):310-7. [DOI:10.1152/physiol.00022.2013]
32. Cheng LK, Komuro R, Austin TM, Buist ML, Pullan AJ. Anatomically realistic multiscale models of normal and abnormal gastrointestinal electrical activity. World journal of gastroenterology: WJG. 2007;13(9):1378. [DOI:10.3748/wjg.v13.i9.1378]
33. Mazloom R. A new approach for digestive disease diagnosis: Dynamics of gastrointestinal electrical activity. Medical Hypotheses. 2019;128:64-8. [DOI:10.1016/j.mehy.2019.05.009]
34. Mazloom R. Possibility of Assessing the Gastrointestinal Tract as a Complex System. Journal of Medical Systems 2019;43(3):1-. [DOI:10.1007/s10916-019-1194-8]
35. Zhao J, McMahon B, Fox M, Gregersen H. The esophagiome: integrated anatomical, mechanical, and physiological analysis of the esophago-gastric segment. Ann N Y Acad Sci. 2018;1434(1):5-20. [DOI:10.1111/nyas.13869]
36. Seo Y, Bang S, Son J, Kim D, Jeong Y, Kim P, et al. Brain physiome: A concept bridging in vitro 3D brain models and in silico models for predicting drug toxicity in the brain. Bioact Mater. 2022;13:135-48. [DOI:10.1016/j.bioactmat.2021.11.009]
ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA


XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Mazloom R, Bayat G, Khalili A, Arabi M. An overview of the Physiome Project; a perspective focusing on interdisciplinary studies in the medical sciences. aumj 2024; 13 (1) :63-70
URL: http://aums.abzums.ac.ir/article-1-1602-fa.html

مظلوم رهام، بیات غلامرضا، خلیلی آزاده، اعرابی محسن. مروری بر پروژه فیزیوم؛ دیدگاهی با تمرکز بر مطالعات میان‌رشته‌ای در علوم پزشکی. نشریه علمی پژوهشی دانشگاه علوم پزشکی البرز. 1402; 13 (1) :63-70

URL: http://aums.abzums.ac.ir/article-1-1602-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 13، شماره 1 - ( زمستان 1402 ) برگشت به فهرست نسخه ها
نشریه دانشگاه علوم پزشکی البرز Alborz University Medical Journal
Persian site map - English site map - Created in 0.05 seconds with 39 queries by YEKTAWEB 4657