دوره 11، شماره 3 - ( تابستان 1401 )
جلد 11 شماره 3 صفحات 324-311 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Rohani S, Hajighasemi F. Determination of Superficial Clefts on Fragment of Antigen Binding in Human
Immunoglobulin G by Computational Immunology. aumj 2022; 11 (3) :311-324
URL: http://aums.abzums.ac.ir/article-1-1544-fa.html
URL: http://aums.abzums.ac.ir/article-1-1544-fa.html
روهانی سهیلا، حاجی قاسمی فاطمه. استفاده از ایمونولوژی محاسبه ای برای تعیین شکاف های سطحی ناحیه متصل شونده به آنتی ژن در مولکول ایمونوگلوبولین Gانسان. نشریه علمی پژوهشی دانشگاه علوم پزشکی البرز. 1401; 11 (3) :311-324
1- پزشک،گروه ایمونولوژی، دانشکده پزشکی، دانشگاه شاهد، تهران، ایران
2- دانشیار، گروه ایمونولوژی، دانشکده پزشکی، دانشگاه شاهد، تهران، ایران
2- دانشیار، گروه ایمونولوژی، دانشکده پزشکی، دانشگاه شاهد، تهران، ایران
چکیده: (1222 مشاهده)
زمینه و هدف: ایمونوگلوبولین ها] immunoglobulins (Igs) [ گلیکوپروتئینهای دفاعی بدن هستند که میکروبها را به صورت اختصاصی شناسایی و تخریب می‌کنند. ناحیه ای از آنتی بادی که به آنتی ژن متصل میشود، fragment of antigen binding (Fab) نامیده میشود که حاوی دومینهای متغیر و یک دومین ثابت از زنجیره های ســبک و ســنگین میباشد. ایدیوتیپها که اپیتوپهای واقع بر ناحیه متغیر ایمونوگلوبولینها هستند، برای ردیابی و هدفگیری سلولهای B سرطانی بکار میروند و معمولا نزدیک شکاف های سطحی Igها واقع شده اند. هدف این پژوهش بــکارگیری ایمونولــوژی محاسبه ای بـرای تعیـین شکاف های سطحی ناحیه Fab می باشد.
مواد و روشها: توالی و ساختار سوم مولکول ایمونوگلوبولینG (IgG) مرجع انسان در پایگاه داده PDB (Protein Data Bank) بدست آمدند. شکاف های سطحی ناحیه Fab-IgG توسط نرم افزارهای Profunc در پایگاه اینترنتی http://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/profunc و Isocleft finder تعیین گردیدند.
یافته ها: ده شکاف در سطح مولکول IgG توسط نرم افزار Cleft Analysis شناسایی شدند. دو تا از بزرگترین این شکاف ها در ناحیه متغیر و سومین شکاف در ناحیه ثابت Fab واقع شده اند. همچنین سه شکاف توسط نرم افزار Isocleft finder شناسایی شدند که دو تا از آنها از اشتراک دومینهای متغیر و ثابت و سومی از دومینهای ثابت ناحیه Fab تشکیل شده اند.
نتیجه گیری: شکاف های سطحی IgG شناسایی شده در این مطالعه میتوانند در تعیین اپیتوپهای مولکول IgG، ایدیوتیپهای اختصاصی و تولید آنتی بادیهای منوکلونـال اختصاصی ضد ایدیوتیپ جهت رد یابی و هدف گیری سلولهای B بدخیم، طراحی و تولید پروتئینهای مشابه برای اهداف تشخیصی و درمانی مورد استفاده قرار گیرند.
مواد و روشها: توالی و ساختار سوم مولکول ایمونوگلوبولینG (IgG) مرجع انسان در پایگاه داده PDB (Protein Data Bank) بدست آمدند. شکاف های سطحی ناحیه Fab-IgG توسط نرم افزارهای Profunc در پایگاه اینترنتی http://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/profunc و Isocleft finder تعیین گردیدند.
یافته ها: ده شکاف در سطح مولکول IgG توسط نرم افزار Cleft Analysis شناسایی شدند. دو تا از بزرگترین این شکاف ها در ناحیه متغیر و سومین شکاف در ناحیه ثابت Fab واقع شده اند. همچنین سه شکاف توسط نرم افزار Isocleft finder شناسایی شدند که دو تا از آنها از اشتراک دومینهای متغیر و ثابت و سومی از دومینهای ثابت ناحیه Fab تشکیل شده اند.
نتیجه گیری: شکاف های سطحی IgG شناسایی شده در این مطالعه میتوانند در تعیین اپیتوپهای مولکول IgG، ایدیوتیپهای اختصاصی و تولید آنتی بادیهای منوکلونـال اختصاصی ضد ایدیوتیپ جهت رد یابی و هدف گیری سلولهای B بدخیم، طراحی و تولید پروتئینهای مشابه برای اهداف تشخیصی و درمانی مورد استفاده قرار گیرند.
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
