دوره 9، شماره 4 - ( پاییز 1399 )
جلد 9 شماره 4 صفحات 404-395 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Moghaddam F, Taghizadeh M, Mansouri R, Dabaghian M. Designing of A Multi-epitope Recombinant Protein, Consisting of Several Conserved Epitopes from Hemagglutinin Protein of the H1N1 and H5N1 Strains of Influenza Virus by Immunoinformatics Approaches. aumj 2020; 9 (4) :395-404
URL: http://aums.abzums.ac.ir/article-1-1146-fa.html
URL: http://aums.abzums.ac.ir/article-1-1146-fa.html
مقدم فرناز، تقی‌زاده طرنابی مرتضی، منصوری رضا، تبیانیان مجید، دباغیان مهران. طراحی پروتئین نوترکیب حاوی اپی توپ های محافظت شده آنتی‌ژن هماگلوتینین ویروس آنفولانزای سویه های H1N1 و H5N1 با استفاده از روش‌های بیوانفورماتیک. نشریه علمی پژوهشی دانشگاه علوم پزشکی البرز. 1399; 9 (4) :395-404
فرناز مقدم1 
، مرتضی تقی‌زاده طرنابی2 ، رضا منصوری1 
، مجید تبیانیان*3 ، مهران دباغیان2
، مرتضی تقی‌زاده طرنابی2 ، رضا منصوری1 ، مجید تبیانیان*3 ، مهران دباغیان2
1- گروه ایمونولوژی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی شهید صدوقی یزد
2- گروه تحقیق و توسعه، موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، سازمان تحقیقات آموزش و ترویج کشاورزی، کرج
3- گروه تحقیق و توسعه، موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، سازمان تحقیقات آموزش و ترویج کشاورزی، کرج ،majidtebianian@gmail.com
2- گروه تحقیق و توسعه، موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، سازمان تحقیقات آموزش و ترویج کشاورزی، کرج
3- گروه تحقیق و توسعه، موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، سازمان تحقیقات آموزش و ترویج کشاورزی، کرج ،
چکیده: (2420 مشاهده)
مقدمه: درسال های اخیر و با توجه به پیشرفت های انجام شده درحوزه بیوانفورماتیک، طراحی واکسن آنفولانزا دستخوش پیشرفت های قابل ملاحظه ای شده است. هدف از این مطالعه طراحی یک پروتئین نوترکیب چندظرفیتی برمبنای اپی توپ بسیار محافظت شده پروتئین هماگلوتینین سویه‌های H1N1 و H5N1 است که در طی زمان دچار تغییر و موتاسیون نمی شوند.
روش کار: برای این منظور و با توجه به مطالعات میدانی قبلی توالی سویه‌های مورد نظر بررسی شد و اپی‌توپ‌هایی از این سویه‌ها انتخاب شدند.پس از بررسی خصوصیات ایمنی زائی و شیمیائی اپی توپ های انتخاب شده توسط سرور های مناسب، ساختاراولیه پروتئین نوترکیب تعیین شد و متعاقب ترجمه معکوس توالی فوق ، بهینه‌سازی کدون انجام شد و در نهایت توالی بهینه شده در درون وکتور PET32a+ و دربین دو ناحیه آنزیمی BamHI/XhoI قرارداده شد.
نتایج: نتایج بدست آمده نشان داد که پروتئین نوترکیب حاصله دراین مطالعه دارای وزن ملکولی 22451.72 g/mol با 214 اسید آمینه می باشد. pH ایزوالکتریک پروتئین فوق 25/7 و میزان حلالیت آن درسیستم پروکاریوتی 100 درصد است. ضریب خاموشی ساختار فوق نیز به میزان M-1cm-1 60170 تعیین شد. در نهایت و پس ازبهینه سازی کدون، شاخص انطباق کدون ( CAI)پروتئین نیز به میزان 95/0محاسبه گردید.
نتیجه‌گیری: در نهایت وباتوجه به داده‌های فوق پیش‌بینی می‌شود که ساختار چند اپی توپی طراحی شده دراین مطالعه که دارای خصوصیات ایمونولوژیکی منحصر بفرد و قابل قبولی است را می‌توان با موفقیت و به میزان قابل قبولی درسیستم پروکاریوتی بیان نمود و جهت مطالعات ایمنی زائی برعلیه ویروس آنفولانزای A مورداستفاده قرار داد.
روش کار: برای این منظور و با توجه به مطالعات میدانی قبلی توالی سویه‌های مورد نظر بررسی شد و اپی‌توپ‌هایی از این سویه‌ها انتخاب شدند.پس از بررسی خصوصیات ایمنی زائی و شیمیائی اپی توپ های انتخاب شده توسط سرور های مناسب، ساختاراولیه پروتئین نوترکیب تعیین شد و متعاقب ترجمه معکوس توالی فوق ، بهینه‌سازی کدون انجام شد و در نهایت توالی بهینه شده در درون وکتور PET32a+ و دربین دو ناحیه آنزیمی BamHI/XhoI قرارداده شد.
نتایج: نتایج بدست آمده نشان داد که پروتئین نوترکیب حاصله دراین مطالعه دارای وزن ملکولی 22451.72 g/mol با 214 اسید آمینه می باشد. pH ایزوالکتریک پروتئین فوق 25/7 و میزان حلالیت آن درسیستم پروکاریوتی 100 درصد است. ضریب خاموشی ساختار فوق نیز به میزان M-1cm-1 60170 تعیین شد. در نهایت و پس ازبهینه سازی کدون، شاخص انطباق کدون ( CAI)پروتئین نیز به میزان 95/0محاسبه گردید.
نتیجه‌گیری: در نهایت وباتوجه به داده‌های فوق پیش‌بینی می‌شود که ساختار چند اپی توپی طراحی شده دراین مطالعه که دارای خصوصیات ایمونولوژیکی منحصر بفرد و قابل قبولی است را می‌توان با موفقیت و به میزان قابل قبولی درسیستم پروکاریوتی بیان نمود و جهت مطالعات ایمنی زائی برعلیه ویروس آنفولانزای A مورداستفاده قرار داد.
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
