fa تعیین ژن های کلیدی و مسیر های پیام رسانی سلولی دخیل در مقاومت بیماران مبتلا به لنفوم سلول B بزرگ منتشر نسبت به درمان ریشه کن سازی هلیکوباکتر پیلوری تخصصي Special پژوهشي Research <span style="font-size:12pt"><span style="line-height:150%"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span lang="FA" style="font-size:14.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" style="font-family:" titr=""><span style="color:black">زمینه و هدف: </span></span></span></span><span lang="FA" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" nazanin="" style="font-family:"><span style="color:black">لنفوم سلول </span></span></span></span><span dir="LTR" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%"><span style="color:black">B</span></span></span><span lang="FA" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" nazanin="" style="font-family:"><span style="color:black"> بزرگ منتشر شایع ترین لنفوم غیر هوجکین مهاجم می باشد. ارتباطی قوی میان عفونت با باکتری هلیکوباکتر پیلوری با بروز این بدخیمی مشاهده شده است. دیده شده برخی از بیمارانی که مبتلا به </span></span></span></span><span dir="LTR" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%"><span style="color:black">DLBCL</span></span></span><span lang="FA" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" nazanin="" style="font-family:"><span style="color:black"> در مراحل ابتدایی هستند پاسخ خوبی به درمان ریشه کنی هلیکوباکتر پیلوری می دهند ولی برخی دیگر نسبت به این درمان مقاومند. با توجه به کمبود اطلاعات کافی راجع به نحوه بروز این مقاومت، لازم است سازوکار های فعال در بیماران مقاوم شناسایی گردد.</span></span></span></span><span lang="FA" style="font-size:14.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" style="font-family:" titr=""><span style="color:black"></span></span></span></span></span></span></span></span></span><br> <span style="font-size:12pt"><span style="line-height:150%"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span lang="FA" style="font-size:14.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" style="font-family:" titr=""><span style="color:black">&nbsp;مواد و روش‌ها: </span></span></span></span><span lang="FA" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" nazanin="" style="font-family:"><span style="color:black">داده های بیان ژنی بیماران حساس و بیماران مقاوم به درمان از سایت </span></span></span></span><span dir="LTR" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%"><span style="color:black">GEO</span></span></span><span lang="FA" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" nazanin="" style="font-family:"><span style="color:black"> دریافت شدند. پس از تعیین ژن های با بیان تغییر یافته، به منظور شناسایی ژن های کلیدی شبکه ارتباطات پروتئینی ساخته شده و ژن های مهم بر اساس شاخص های شبکه ای غربال گردیدند. در نهایت مسیر های پیام رسانی سلولی مرتبط با ژن های کلیدی مشخص شدند.</span></span></span></span><span lang="FA" style="font-size:14.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" style="font-family:" titr=""><span style="color:black"></span></span></span></span></span></span></span></span></span><br> <span style="font-size:12pt"><span style="line-height:150%"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span lang="FA" style="font-size:14.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" style="font-family:" titr=""><span style="color:black">یافته‌ها: </span></span></span></span><span lang="FA" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" nazanin="" style="font-family:">ژن های </span></span></span><span dir="LTR" lang="EN-GB" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%">CXCL8</span></span><span lang="FA" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" nazanin="" style="font-family:">، </span></span></span><span dir="LTR" lang="EN-GB" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%">EGFR</span></span><span lang="FA" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" nazanin="" style="font-family:">، </span></span></span><span dir="LTR" lang="EN-GB" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%">FN1</span></span><span lang="FA" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" nazanin="" style="font-family:">، </span></span></span><span dir="LTR" lang="EN-GB" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%">ICAM1</span></span><span lang="FA" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" nazanin="" style="font-family:">، </span></span></span><span dir="LTR" lang="EN-GB" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%">IL1B</span></span><span lang="FA" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" nazanin="" style="font-family:">، </span></span></span><span dir="LTR" lang="EN-GB" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%">TLR2</span></span><span lang="FA" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" nazanin="" style="font-family:">، </span></span></span><span dir="LTR" lang="EN-GB" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%">TLR4</span></span><span lang="FA" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" nazanin="" style="font-family:">، </span></span></span><span dir="LTR" lang="EN-GB" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%">TNF</span></span><span lang="FA" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" nazanin="" style="font-family:"> و </span></span></span><span dir="LTR" lang="EN-GB" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%">VEGFA</span></span><span lang="FA" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" nazanin="" style="font-family:"> با توجه به ویژگی های شبکه ای و نتایج به دست آمده از تعیین مسیر های پیام رسانی سلولی به عنوان ژن های با اهمیت بالا مشخص شدند. ژن های کلیدی ارتباط قابل توجهی با عملکرد های مرتبط با تنظیم فعالیت سلول های ایمنی نشان دادند.</span></span></span><span lang="FA" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" style="font-family:" titr=""><span style="color:black"></span></span></span></span></span></span></span></span></span><br> <span style="font-size:12pt"><span style="line-height:150%"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span lang="FA" style="font-size:14.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" style="font-family:" titr=""><span style="color:black">نتیجه‌گیری: </span></span></span></span><span lang="FA" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" nazanin="" style="font-family:">نتایج به دست آمده از این مطالعه نشان دهنده نقش قابل توجه عملکرد های سلولی مرتبط با گیرنده های سطحی و همچنین تنظیم فعال سازی آنها در بروز مقاومت نسبت به درمان می باشد. ژن ها و مسیر های سلولی مشخص شده در این مطالعه می توانند به عنوان اهداف ژن درمانی و زیست نشانگر هایی جهت تشخیص، تعیین روش درمانی مناسب برای بیمار و پیش آگهی استفاده گردند.</span></span></span></span></span></span></span></span> <span style="font-size:12pt"><span style="line-height:150%"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%">Background: </span></span></b><span style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%">Diffuse large B-cell lymphoma is the most common invasive non-Hodgkin&#39;s lymphoma. There is a strong relationship between Helicobacter pylori infection and the occurrence of this malignancy. It has been seen that some patients with DLBCL in the early stages respond well to Helicobacter pylori eradication treatment, but others are resistant to it. Due to the lack of sufficient knowledge about the occurrence of this resistance, it is necessary to identify mechanisms of resistance.</span></span></span></span></span></span><br> <span style="font-size:12pt"><span style="line-height:150%"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%">Methods: </span></span></b><span style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%">The gene expression data of sensitive and resistant patients were obtained from GEO site. After determining the genes with altered expression, in order to identify the key genes, the protein interaction network was constructed and the important genes were filtered based on the network centrality indices. Finally, cellular signaling pathways associated with key genes were determined.</span></span></span></span></span></span><br> <span style="font-size:12pt"><span style="line-height:150%"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%">Results: </span></span></b><span style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%">CXCL8, EGFR, FN1, ICAM1, IL1B, TLR2, TLR4, TNF and VEGFA genes were identified as highly important genes according to the network analysis and the results obtained from the pathway enrichment analysis. Key genes showed a significant relationship with functions related to the regulation of immune cells activation.</span></span></span></span></span></span><br> <span style="font-size:12pt"><span style="line-height:150%"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%">Conclusion: </span></span></b><span style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%">The results obtained from this study show the significant role of cell functions related to surface receptors and also the regulation of immune cells activation in the occurrence of resistance to treatment. The genes and cellular pathways identified in this study can be used as therapeutic targets and biomarkers for diagnosis, determination of the appropriate treatment method for the patients and prognosis.</span></span></span></span></span></span> لنفوم سلول B بزرگ منتشر, DLBCL, بیوانفورماتیک, هلیکوباکتر پیلوری Diffuse large B-cell lymphoma, DLBCL, Bioinformatics, Helicobacter pylori 103 113 http://aums.abzums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-956-3&slc_lang=fa&sid=1 Mohammad-Moien Forghani-Ramandi محمد معین فرقانی رامندی 100319475328460012263 100319475328460012263 No Student Research Committee, School of Medicine, Alborz University of Medical Sciences, Karaj, Iran دانشجوی رشته پزشکی، کمیته تحقیقات دانشجویی، دانشگاه علوم پزشکی البرز، کرج، ایران Arvin Najafi آروین نجفی 100319475328460012264 100319475328460012264 Yes Assistant Professor of Orthopedics, School of Medicine, Clinical Research Development Unit, Shahid Madani Hospital, Alborz University of Medical Sciences, Karaj, Iran استادیار گروه ارتوپدی، واحد توسعه و تحقیقات بالینی بیمارستان شهید مدنی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی البرز، کرج، ایران