fa بررسی دو روش فنل-کلروفرم و استفاده از نانوذرات مغناطیسی جهت استخراج DNA ژنومی باکتری استافیلوکوکوس اورئوس تخصصي Special پژوهشي Research <span style="font-size:9pt"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span lang="FA" style="font-size:10.0pt"><span b="" lotus="" style="font-family:">زمینه و هدف:</span></span></b><span lang="FA" style="font-size:10.0pt"><span b="" lotus="" style="font-family:"> جدا کردن </span></span>DNA<span lang="FA" style="font-size:10.0pt"><span b="" lotus="" style="font-family:"> ژنومی از سلول</span></span><span b="" dir="LTR" lotus="" style="font-family:">&zwj;</span><span lang="FA" style="font-size:10.0pt"><span b="" lotus="" style="font-family:">های باکتریایی از جمله فرایندهایی است که به طور معمول در اکثر آزمایشگاه‌های بیولوژیک انجام می‌گیرد، لذا برای آن روش‌های گوناگونی ارائه شده است. در این مطالعه از دو روش فنل و کلروفرم،</span></span> <span lang="FA" style="font-size:10.0pt"><span b="" lotus="" style="font-family:">و استفاده از نانوذرات مغناطیسی در جهت استخراج</span></span>DNA &nbsp;<span lang="FA" style="font-size:10.0pt"><span b="" lotus="" style="font-family:">ژنومی باکتری <i>استافیلوکوکوس اورئوس</i> استفاده شده است.</span></span></span></span></span></span><br> <span style="font-size:9pt"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span lang="FA" style="font-size:10.0pt"><span b="" lotus="" style="font-family:">مواد و روش ها:</span></span></b><b> </b><span lang="FA" style="font-size:10.0pt"><span b="" lotus="" style="font-family:">در مطالعه حاضر از باکتری <i>استافیلوکوکوس اورئوس</i> سویه استاندارد<b> </b>به شماره </span></span>ATCC 25923<b> </b><span lang="FA" style="font-size:10.0pt"><span b="" lotus="" style="font-family:">استفاده گردید. جهت استخراج<b> </b></span></span>DNA <span lang="FA" style="font-size:10.0pt"><span b="" lotus="" style="font-family:">ژنومی از دو روش فنل</span></span>-<span lang="FA" style="font-size:10.0pt"><span b="" lotus="" style="font-family:">کلروفرم و استخراج به وسیله</span></span><span lang="FA" style="font-size:10.0pt"><span b="" lotus="" style="font-family:"> نانوذرات مغناطیسی استفاده شد. جهت بررسی کیفیت و غلظت </span></span>DNA<span lang="FA" style="font-size:10.0pt"><span b="" lotus="" style="font-family:"> استخراج شده با دو روش فوق از دستگاه نانودراپ و روش الکتروفورز روی ژل آگارز استفاده گردید.&nbsp;&nbsp; </span></span></span></span></span></span><br> <span style="font-size:9pt"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span lang="FA" style="font-size:10.0pt"><span b="" lotus="" style="font-family:">یافته</span></span></b>‌<b><span lang="FA" style="font-size:10.0pt"><span b="" lotus="" style="font-family:">ها:</span></span></b><b> </b><span lang="FA" style="font-size:10.0pt"><span b="" lotus="" style="font-family:">بررسی غلظت </span></span>DNA<span lang="FA" style="font-size:10.0pt"><span b="" lotus="" style="font-family:"> استخراج شده در هر دو روش، توسط نانودراپ انجام شد که غلظت </span></span>DNA<span lang="FA" style="font-size:10.0pt"><span b="" lotus="" style="font-family:"> استخراج شده در روش فنل-کلروفرم و استفاده از نانوذرات مغناطیسی</span></span> Fe₃O₄/SiO₂_&nbsp;<span lang="FA" style="font-size:10.0pt"><span b="" lotus="" style="font-family:">به ترتیب 4/550</span></span> <span lang="FA" style="font-size:10.0pt"><span b="" lotus="" style="font-family:">و 6/131 میکروگرم بر میلی لیتر به دست آمد.</span></span></span></span></span></span><br> <span style="font-size:9pt"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span lang="FA" style="font-size:10.0pt"><span b="" lotus="" style="font-family:">بحث و نتیجه گیری</span></span></b><span lang="FA" style="font-size:10.0pt"><span b="" lotus="" style="font-family:">:</span></span> <span lang="FA" style="font-size:10.0pt"><span b="" lotus="" style="font-family:">از یافته‌های این تحقیق &nbsp;می‌توان نتیجه گرفت که با توجه به دیواره‌ ضخیم باکتری <i>استافیلوکوکوس اورئوس<span style="color:red">،</span></i> استخراج </span></span>DNA<span lang="FA" style="font-size:10.0pt"><span b="" lotus="" style="font-family:"> ژنومی به وسیله نانوذرات مغناطیسی<b> </b></span></span>Fe₃O₄<span lang="FA" style="font-size:10.0pt">/</span>SiO₂<span lang="FA" style="font-size:10.0pt"><span b="" lotus="" style="font-family:"> دارای غلظت و خلوصی قابل قبول برای انجام پروسه های مولکولی مانند </span></span>PCR<span lang="FA" style="font-size:10.0pt"><span b="" lotus="" style="font-family:"> است و می‌تواند به عنوان جایگزین سایر روش های استخراج استفاده شود.</span></span></span></span></span></span><br> <span style="font-size:9pt"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span b="" lotus="" style="font-family:"><span style="color:black"></span></span></span></span></span></span><br> &nbsp; <span style="font-size:10pt"><span style="line-height:12pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span style="color:black">Background and Aim:</span></b><span style="color:black"> Isolation of genomic DNA from bacterial cells is one of the processes typically performed in most biological laboratories</span> <span style="color:black">and there are different methods to do it</span><span b="" dir="RTL" lotus="" style="font-family:"><span style="color:black"> .</span></span><span style="color:black">In this study, two methods including phenol-chloroform, and magnetic nanoparticles, were used to extract genomic DNA of <i>Staphylococcus aureus</i>.</span></span></span></span><br> <span style="font-size:10pt"><span style="line-height:12pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span style="color:black">Materials and Methods:</span></b><span style="color:black"> In the present</span> <span style="color:black">study, the standard strain of <i>Staphylococcus aureus</i> ATCC 25923 was used for extraction of genomic DNA by phenol-chloroform and magnetic nanoparticles methods. Nanodrop and electrophoresis on agarose gel were used to evaluate the quality and concentration of extracted DNA.</span></span></span></span><br> <span style="font-size:10pt"><span style="line-height:12pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span style="color:black">Results:</span></b><span style="color:black"> The concentration of extracted DNA by phenol-chloroform and magnetic nanoparticle) SiO2/Fe3O4) methods were obtained 550.4 and 131.6 &micro;g/ml respectively. </span></span></span></span><br> <span style="font-size:10pt"><span style="line-height:12pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span style="color:black">Conclusion:</span></b><span style="color:black"> From the findings of this study it can be concluded that due to the thick wall of <i>Staphylococcus aureus</i>, genomic DNA extraction by magnetic nanoparticles</span> <span style="color:black">(Fe3O4/SiO2) have acceptable concentration and purity for molecular processes such as PCR, and can be used as an alternative to other extraction methods.</span></span></span></span><br> &nbsp; استافیلوکوکوس اورئوس, استخراج DNA, نانوذرات مغناطیسی, فنل-کلروفرم, ژنوم باکتری Staphylococcus aureus, DNA extraction, Magnetic nanoparticles, Phenol-chloroform, Bacterial genome 42 48 http://aums.abzums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-617-23&slc_lang=fa&sid=1 Hadiseh Rostami حدیثه رستمی 100319475328460010631 100319475328460010631 No MSc, Department of Biology, Faculty of Basic Sciences, Islamic Azad University, Science and Research Branch, Tehran, Iran کارشناسی ارشد، گروه تخصصی زیست شناسی، دانشکده علوم پایه دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات تهران، ایران Farzaneh Firoozeh فرزانه فیروزه 100319475328460010632 100319475328460010632 Yes Associate Professor, Department of Microbiology, School of Medicine, Alborz University of Medical Sciences, Karaj, Iran Research Center for Herbal Medicine and Complementary Medicine, Alborz University of Medical Sciences, Karaj, Iran دانشیار، گروه میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی البرز، کرج، ایران مرکز تحقیقات گیاه درمانی و طب مکمل مبتنی بر شواهد, دانشگاه علوم پزشکی البرز، کرج، ایران Mohammad Zibaei محمد زیبایی 100319475328460010633 100319475328460010633 No Research Center for Herbal Medicine and Complementary Medicine, Alborz University of Medical Sciences, Karaj, Iran Professor, Department of Parasitology and Mycology, School of Medicine, Alborz University of Medical Sciences, Karaj, Iran مرکز تحقیقات گیاه درمانی و طب مکمل مبتنی بر شواهد, دانشگاه علوم پزشکی البرز، کرج، ایران استاد، گروه انگل شناسی و قارچ شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی البرز، کرج، ایران Iman Salahshoorifar ایمان سلحشوری فر 100319475328460010634 100319475328460010634 No Assistant Professor, Department of Genetic, Faculty of Basic Sciences, Islamic Azad University, Science and Research Branch, Tehran, Iran استادیار، گروه ژنتیک، دانشکده علوم پایه دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات تهران، ایران Ali Sobhani-Nasab علی سبحانی نسب 100319475328460010635 100319475328460010635 No Assistant Professor, Physiology Research Center, Basic Sciences Research Institute, Kashan University of Medical Sciences, Kashan, Iran استادیار، مرکز تحقیقات فیزیولوژی,، پژوهشکده علوم پایه، دانشگاه علوم پزشکی کاشان، کاشان، ایران Vajihe Sadat Nilkbin وجیهه سادات نیک بین 100319475328460010636 100319475328460010636 No PhD, Department of Bacteriology, Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran دکتری تخصصی، بخش باکتری شناسی، انستیتو پاستور ایران، تهران، ایران