fa بررسی مقایسه‌ای اسید نوکلئیک استخراج‌شده از باکتری اشریشیا کلای با دو روش استخراج با فنل-کلروفرم و تکنیک استفاده از نانو ذرات مغناطیسی تخصصي Special پژوهشي Research <strong><span style="font-family:B Lotus;"><span style="font-size:10.0pt;">مقدمه:</span></span></strong><span style="font-family:B Lotus;"><span style="font-size:10.0pt;"> از موضوعات مهم پژوهش‌ها در زمینه‌های مولکولی و مهندسی ژنتیک، استفاده از روش‌های بهینه در استخراج محتوای ژنومی میکروارگانیسم‌ها و سلول‌ها است که با استفاده از آن بتوان با صرف کمترین زمان و هزینه، به بیشترین مقدار و مناسب‌ترین خلوص دست‌یافت. روش‌های متعددی در راستای استخراج </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:9.0pt;">DNA</span></span></span><span style="font-family:B Lotus;"><span style="font-size:10.0pt;"> باکتری‌ها وجود دارد که از روش‌های نوین جداسازی اسید نوکلئیک می‌توان به استفاده از نانو ذرات مغناطیسی اشاره نمود. هدف از این مطالعه، مقایسه دو روش استخراج </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:9.0pt;">DNA</span></span></span><span style="font-family:B Lotus;"><span style="font-size:10.0pt;"> از باکتری <em>اشریشیا کلای</em> با دو تکنیک فنل <strong>- </strong>کلروفرم و استفاده از نانو ذرات مغناطیسی است.</span></span><br> <strong><span style="font-family:B Lotus;"><span style="font-size:10.0pt;">روش بررسی</span></span></strong><span style="font-family:B Lotus;"><span style="font-size:10.0pt;">: در این مطالعه از باکتری <em>اشریشیا کلای</em> سویه 25922</span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:9.0pt;">ATCC</span></span></span><span style="font-family:B Lotus;"><span style="font-size:10.0pt;"> جهت مقایسه دو روش استخراج </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:9.0pt;">DNA</span></span></span><span style="font-family:B Lotus;"><span style="font-size:10.0pt;"> ژنومی استفاده گردید. جهت استخراج </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:9.0pt;">DNA</span></span></span><span style="font-family:B Lotus;"><span style="font-size:10.0pt;"> ژنومی از روش فنل<strong>-</strong>کلروفرم و نیز تکنیک استفاده از نانو ذرات مغناطیسی با بکارگیری نانوذره دولایه </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:9.0pt;">SiO2/Fe3O4</span></span></span><span style="font-family:B Lotus;"><span style="font-size:10.0pt;"> استفاده گردید. هر دو محصول به‌دست‌آمده جهت سنجش جذب نوری با دستگاه نانودرآپ قرائت و سپس از طریق روش الکتروفورز روی ژل آگارز بررسی گردیدند.</span></span><br> <strong><span style="font-family:B Lotus;"><span style="font-size:10.0pt;">نتایج</span></span></strong><span style="font-family:B Lotus;"><span style="font-size:10.0pt;">: در بررسی میزان جذب نوری با استفاده از دستگاه نانودرآپ میزان غلظت </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:9.0pt;">DNA</span></span></span><span style="font-family:B Lotus;"><span style="font-size:10.0pt;"> استخراج‌شده با روش فنل<strong>-</strong> کلروفرم 4/761 میکروگرم بر میلی‌لیتر و با استفاده از تکنیک استخراج با نانو ذرات مغناطیسی 531 میکروگرم بر میلی‌لیتر به دست آمد. </span></span><br> <strong><span style="font-family:B Lotus;"><span style="font-size:10.0pt;">نتیجه‌گیری</span></span></strong><span style="font-family:B Lotus;"><span style="font-size:10.0pt;">: با توجه به نتایج به‌دست‌آمده و با مقایسه جذب‌های نوری دو محصول و نیز ارزیابی مقایسه‌ای با گروه‌های کنترل در استخراج به روش نانو ذرات مغناطیسی و نیز با مقایسه فاکتورهای مختلفی نظیر میزان زمان موردنیاز، هزینه‌ها، کاربری آسان می‌توان نتیجه گرفت که به دلیل زمانبر و خطرآفرین بودن روش فنل<strong> -</strong> کلروفرم، روش استفاده از نانو ذرات مغناطیسی یک روش مناسب برای استخراج محتوی ژنومی است. </span></span> <strong>Background:</strong> The most important researches in molecular and genetic engineering fields are the finding of optimal methods for extraction of the genomic content of microorganisms and cells using them, can achieve the most amount and purity with the least time and cost. There are several methods for the extraction of bacterial DNA and the use of magnetic nanoparticles is one of the novel methods of nucleic acid isolation. The aim of this study is to compare DNA extracted from <em>Escherichia coli</em> using two techniques including phenol-chloroform and magnetic nanoparticles.<br> <strong>Methods: </strong>In this study, <em>Escherichia coli</em> strain ATCC25922 was used to compare the two extraction methods. For genomic DNA extraction the phenol-chloroform methods as well as the technique of using bilayer SiO2/Fe3O4 magnetic nanoparticles were used. Both products were analyzed by nanodrop and following agarose gel electrophoresis.<br> <strong>Results:</strong> The results of optical density (OD) evaluation with nanodrop spectrophotometer showed that the concentration of extracted DNA with conventional phenol-chloroform method and magnetic nanoparticle extraction technique were 761.4 &micro;g/ml and 531 &micro;g/ml respectively.<br> <strong>Conclusion:</strong> According to the obtained results by comparing the optical absorption of the two products and comparative evaluation with control groups in magnetic nanoparticle extraction method, also by comparing different factors such as the amount of time required, costs, ease of use, it can be concluded that due to the time-consuming and dangerous nature of the phenol-chloroform method, the using magnetic nanoparticles is an appropriated method for extracting the genomic content. استخراج DNA, فنل - کلروفرم, نانو ذرات, اشریشیا کلای DNA extraction, Phenol-chloroform, Nanoparticles, Escherichia coli 235 240 http://aums.abzums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-869-2&slc_lang=fa&sid=1 Ala Amiri آلا امیری 10031947532846006570 10031947532846006570 No Department of Biology, Faculty of Basic Sciences, Islamic Azad University, Science and Research Branch, Tehran, Iran کارشناسی ارشد زیست‌فناوری میکروبی، دانشکده علوم پایه دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات، تهران، ایران Farzaneh Firoozeh فرزانه فیرزوزه firoozeh823@gmail.com 10031947532846006571 10031947532846006571 Yes Department of Microbiology, School of Medicine, Alborz University of Medical Sciences, Karaj, Iran Research Center for Herbal Medicine and Complementary Medicine, Alborz University of Medical Sciences, Karaj, Iran دانشیار، گروه میکروب‌شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی البرز، کرج، ایران مرکز تحقیقات گیاه‌درمانی و طب مکمل مبتنی بر شواهد، دانشگاه علوم پزشکی البرز، کرج، ایران Mohammad Zibaei محمد زیبایی 10031947532846006572 10031947532846006572 No Research Center for Herbal Medicine and Complementary Medicine, Alborz University of Medical Sciences, Karaj, Iran مرکز تحقیقات گیاه‌درمانی و طب مکمل مبتنی بر شواهد، دانشگاه علوم پزشکی البرز، کرج، ایران استاد، گروه انگل‌شناسی و قارچ‌شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی البرز، کرج، ایران Iman Salahshoorifar ایمان سلحشوری فر 10031947532846006573 10031947532846006573 No Department of Genetic, Faculty of Basic Sciences, Islamic Azad University, Science and Research Branch, Tehran, Iran گروه ژنتیک دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم تحقیقات، تهران، ایران