فرناز مقدم، مرتضی تقی‌زاده طرنابی، رضا منصوری، مجید تبیانیان، مهران دباغیان،
دوره ۹، شماره ۴ - ( پاییز ۱۳۹۹ )
چکیده
مقدمه: درسال های اخیر و با توجه به پیشرفت های انجام شده درحوزه بیوانفورماتیک، طراحی واکسن آنفولانزا دستخوش پیشرفت های قابل ملاحظه ای شده است. هدف از این مطالعه طراحی یک پروتئین نوترکیب چندظرفیتی برمبنای اپی توپ بسیار محافظت شده پروتئین هماگلوتینین سویه‌های H۱N۱ و H۵N۱ است که در طی زمان دچار تغییر و موتاسیون نمی شوند.
روش کار: برای این منظور و با توجه به مطالعات میدانی قبلی توالی سویه‌های مورد نظر بررسی شد و اپی‌توپ‌هایی از این سویه‌ها انتخاب شدند.پس از بررسی خصوصیات ایمنی زائی و شیمیائی اپی توپ های انتخاب شده توسط سرور های مناسب، ساختاراولیه پروتئین نوترکیب تعیین شد و متعاقب ترجمه معکوس توالی فوق ، بهینه‌سازی کدون انجام شد و در نهایت توالی بهینه شده در درون وکتور PET۳۲a+ و دربین دو ناحیه آنزیمی BamHI/XhoI قرارداده شد.
نتایج: نتایج بدست آمده نشان داد که پروتئین نوترکیب حاصله دراین مطالعه دارای وزن ملکولی ۲۲۴۵۱,۷۲ g/mol با ۲۱۴ اسید آمینه می باشد. pH ایزوالکتریک پروتئین فوق ۲۵/۷ و میزان حلالیت آن درسیستم پروکاریوتی ۱۰۰ درصد است. ضریب خاموشی ساختار فوق نیز به میزان M-۱cm-۱ ۶۰۱۷۰ تعیین شد. در نهایت و پس ازبهینه سازی کدون، شاخص انطباق کدون ( CAI)پروتئین نیز به میزان ۹۵/۰محاسبه گردید.
نتیجه‌گیری: در نهایت وباتوجه به داده‌های فوق پیش‌بینی می‌شود که ساختار چند اپی توپی طراحی شده دراین مطالعه که دارای خصوصیات ایمونولوژیکی منحصر بفرد و قابل قبولی است را می‌توان با موفقیت و به میزان قابل قبولی درسیستم پروکاریوتی بیان نمود و جهت مطالعات ایمنی زائی برعلیه ویروس آنفولانزای A مورداستفاده قرار داد.
