[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
بخش‌های اصلی
اطلاعات نشریه::
آرشیو مجله و مقالات::
برای نویسندگان::
برای داوران::
ثبت نام و اشتراک::
تماس با ما::
تسهیلات پایگاه::
نمایه ها::
::
جستجو در پایگاه

جستجوی پیشرفته
..
دریافت اطلاعات پایگاه
نشانی پست الکترونیک خود را برای دریافت اطلاعات و اخبار پایگاه، در کادر زیر وارد کنید.
..
ثبت شده در

AWT IMAGE

AWT IMAGE

..
:: دوره 12، شماره 1 - ( زمستان 1401 ) ::
جلد 12 شماره 1 صفحات 48-42 برگشت به فهرست نسخه ها
بررسی دو روش فنل-کلروفرم و استفاده از نانوذرات مغناطیسی جهت استخراج DNA ژنومی باکتری استافیلوکوکوس اورئوس
حدیثه رستمی ، فرزانه فیروزه ، محمد زیبایی ، ایمان سلحشوری فر ، علی سبحانی نسب ، وجیهه سادات نیک بین
دانشیار، گروه میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی البرز، کرج، ایران مرکز تحقیقات گیاه درمانی و طب مکمل مبتنی بر شواهد, دانشگاه علوم پزشکی البرز، کرج، ایران
چکیده:   (868 مشاهده)
زمینه و هدف: جدا کردن DNA ژنومی از سلولهای باکتریایی از جمله فرایندهایی است که به طور معمول در اکثر آزمایشگاه‌های بیولوژیک انجام می‌گیرد، لذا برای آن روش‌های گوناگونی ارائه شده است. در این مطالعه از دو روش فنل و کلروفرم، و استفاده از نانوذرات مغناطیسی در جهت استخراجDNA  ژنومی باکتری استافیلوکوکوس اورئوس استفاده شده است.
مواد و روش ها: در مطالعه حاضر از باکتری استافیلوکوکوس اورئوس سویه استاندارد به شماره ATCC 25923 استفاده گردید. جهت استخراج DNA ژنومی از دو روش فنل-کلروفرم و استخراج به وسیله نانوذرات مغناطیسی استفاده شد. جهت بررسی کیفیت و غلظت DNA استخراج شده با دو روش فوق از دستگاه نانودراپ و روش الکتروفورز روی ژل آگارز استفاده گردید.  
یافتهها: بررسی غلظت DNA استخراج شده در هر دو روش، توسط نانودراپ انجام شد که غلظت DNA استخراج شده در روش فنل-کلروفرم و استفاده از نانوذرات مغناطیسی Fe3O4/SiO2  به ترتیب 4/550 و 6/131 میکروگرم بر میلی لیتر به دست آمد.
بحث و نتیجه گیری: از یافته‌های این تحقیق  می‌توان نتیجه گرفت که با توجه به دیواره‌ ضخیم باکتری استافیلوکوکوس اورئوس، استخراج DNA ژنومی به وسیله نانوذرات مغناطیسی Fe3O4/SiO2 دارای غلظت و خلوصی قابل قبول برای انجام پروسه های مولکولی مانند PCR است و می‌تواند به عنوان جایگزین سایر روش های استخراج استفاده شود.

 
واژه‌های کلیدی: استافیلوکوکوس اورئوس، استخراج DNA، نانوذرات مغناطیسی، فنل-کلروفرم، ژنوم باکتری
متن کامل [PDF 319 kb]   (541 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: تخصصي
دریافت: 1401/8/2 | پذیرش: 1401/8/10 | انتشار: 1401/8/10
فهرست منابع
1. Gao X , Yao X, Zhang Z, Jia L. Rapid and sensitive detection of Staphylococcus aureus assisted by polydopamine modified magnetic nanoparticles. Talanta 2018;186:147-153. [DOI:10.1016/j.talanta.2018.04.046]
2. Holden M, Feil E, Lindsay J, et al. Complete genomes of two clinical Staphylococcus aureus strains: evidence for the rapid evolution of virulence and drug resistance. Proceedings of the National Academy of Sciences 2004;101(26):9786-9791. [DOI:10.1073/pnas.0402521101]
3. Sosa-Acosta JR, Silva JA, Fernaʹndez-Izquierdo L, et al. Iron oxide nanoparticles (IONPs) with potential applications in plasmid DNA isolation. Coll Surf A 2018;545(2018):167-178. [DOI:10.1016/j.colsurfa.2018.02.062]
4. Niemirowicz K, Markiewicz KH, Wilczewska AZ, et al. Magnetic nanoparticles as new diagnostic tools in medicine. Adv Med Sci 2012;57(2):196-207. [DOI:10.2478/v10039-012-0031-9]
5. Cheng HR, Jiang N. Extremely rapid extraction of DNA from bacteria and yeasts. Biotechnol Lett 2006;28(1):55- 59. [DOI:10.1007/s10529-005-4688-z]
6. Park D. Genomic DNA isolation from different biological materials. Methods Mol Biol 2007; 353:3-13. [DOI:10.1385/1-59745-229-7:3]
7. Tafvizi F,Osareh A. Comparison of DNA extraction methods from fixed tissue in formalin. J Comp pathobiol Iran 2015;12(3):1677-1682.
8. Intorasoot S, Srirung R, Intorasoot A, et al. Application of gelatin-coated magnetic particles for isolation of genomic DNA from bacterial cells. Anal Biochem 2009; 386(2):291-292. [DOI:10.1016/j.ab.2008.12.032]
9. Berensmeier S. Magnetic particles for the separation and purification of nucleic acids. Appl Microbiol Biotechnol 2006;73(3):495-504. [DOI:10.1007/s00253-006-0675-0]
10. Saiyed ZM, Ramchand CN, Telang SD. Isolation of genomic DNA using magnetic nanoparticles as a solidphase support. J Phys Condens Matter 2008;20(20):204153. [DOI:10.1088/0953-8984/20/20/204153]
11. Ketaki K, Dipak V, Deshmukh M. Isolation of genomic DNA from Escherichia coli K12 Strain by using iron oxide nanoparticles. J Pharm Biol Sci 2015;10(3):49-52.
12. McBain SC, Yiu HHP, EI Haj A, et al. Polyethyleneimine functionalized iron oxide nanoparticles as agents for DNA delivery and transfection. J Mater Chem2007;17(24):2561-2565. [DOI:10.1039/b617402g]
13. Chen XW, Mao QX, Liu JW, et al. Isolation/separation of plasmid DNA using hemoglobin modified magnetic nanocomposites as solid-phase adsorbent. Talanta 2012;100:107-112. [DOI:10.1016/j.talanta.2012.07.095]
14. Maye MM, Nykypanchuk D, Van Der Lelie D, et al. A simple method for kinetic control of DNA induced nanoparticle assembly. J Am Chem Soc 2006;128(43):14020-14021. [DOI:10.1021/ja0654229]
15. Oliveira CF, Paim TG, Reiter KC, et al. Evaluation of four different DNA extraction methods in coagulase-negative staphylococci clinical isolates. Rev Inst Med Trop Sao Paulo 2014;56(1):29-33. [DOI:10.1590/S0036-46652014000100004]
16. Chen L, Zhang J. Bioconjugated magnetic nanoparticles for rapid capture of gram-positive bacteria. J Biosens Bioelectron 2012;S11:1-5. [DOI:10.4172/2155-6210.S11-005]
17. Rahnama H, Sattarzadeh A, Kazemi F, et al. Comparative study of three magnetic nano-particles (FeSO4, FeSO4/SiO2, FeSO4/SiO2/TiO2) in plasmid DNA extraction. Anal Biochem 2016;513:68-76. [DOI:10.1016/j.ab.2016.08.029]
18. Wecke J, Lahav M, Ginsburg I, et al. Cell wall degradation of Staphylococcus aureus by lysozyme. Arch Microbiol 1982;131(2):116-123. [DOI:10.1007/BF01053992]
19. Chakraborti S, Chatterjee T, Joshi P, et al. Langmuir 2010;26(5):3506-3513. [DOI:10.1021/la903118c]
20. Xu Z, Liu XW, Ma YS, et al. Interaction of nano-TiO 2 with lysozyme: insights into the enzyme toxicity of nanosized particles. Environ Sci Pollut Res Int 2010;17(3):798-806. [DOI:10.1007/s11356-009-0153-1]
21. Koc K, Alveroglu E. Adsorption and desorption studies of lysozyme by Fe3O4-polymer nanocomposite via fluorescence spectroscopy. J Mol Struct 2015;1089(2015):66-72. [DOI:10.1016/j.molstruc.2015.02.038]
22. Mardaneh J, Mohammadzadeh AR, Masomian Z. Polyethylene Glycol 200; a rapid and inexpensive method for DNA extraction from gram positive and gram negative bacteria. Q Horizon Med Sci 2015;21:7-11.
23. Mirnejad R, Babavalian H, Moosazadeh Moghadam M, et al. Rapid DNA extraction of bacterial genome using laundry detergents and assessment of the efficiency of DNA in downstream process using polymerase chain reaction. Afr J Biothecnol 2012;11(1):173-178. [DOI:10.5897/AJB11.2259]
ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA



XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Rostami H, Firoozeh F, Zibaei M, Salahshoorifar I, Sobhani-Nasab A, Nilkbin V S. Survey of Two Methods Including Phenol-Chloroform and Application of Magnetic Nanoparticles for Genomic DNA Extraction of Staphylococcus aureus. aumj 2022; 12 (1) :42-48
URL: http://aums.abzums.ac.ir/article-1-1622-fa.html

رستمی حدیثه، فیروزه فرزانه، زیبایی محمد، سلحشوری فر ایمان، سبحانی نسب علی، نیک بین وجیهه سادات. بررسی دو روش فنل-کلروفرم و استفاده از نانوذرات مغناطیسی جهت استخراج DNA ژنومی باکتری استافیلوکوکوس اورئوس. نشریه علمی پژوهشی دانشگاه علوم پزشکی البرز. 1401; 12 (1) :42-48

URL: http://aums.abzums.ac.ir/article-1-1622-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 12، شماره 1 - ( زمستان 1401 ) برگشت به فهرست نسخه ها
نشریه دانشگاه علوم پزشکی البرز Alborz University Medical Journal
Persian site map - English site map - Created in 0.07 seconds with 39 queries by YEKTAWEB 4645