|
استفاده از ایمونولوژی محاسبه ای برای تعیین شکاف های سطحی ناحیه متصل شونده به آنتی ژن در مولکول ایمونوگلوبولین Gانسان
|
سهیلا روهانی    ، فاطمه حاجی قاسمی |
| دانشیار، گروه ایمونولوژی، دانشکده پزشکی، دانشگاه شاهد، تهران، ایران |
|
|
چکیده: (939 مشاهده) |
زمینه و هدف: ایمونوگلوبولین ها] immunoglobulins (Igs) [ گلیکوپروتئینهای دفاعی بدن هستند که میکروبها را به صورت اختصاصی شناسایی و تخریب می‌کنند. ناحیه ای از آنتی بادی که به آنتی ژن متصل میشود، fragment of antigen binding (Fab) نامیده میشود که حاوی دومینهای متغیر و یک دومین ثابت از زنجیره های ســبک و ســنگین میباشد. ایدیوتیپها که اپیتوپهای واقع بر ناحیه متغیر ایمونوگلوبولینها هستند، برای ردیابی و هدفگیری سلولهای B سرطانی بکار میروند و معمولا نزدیک شکاف های سطحی Igها واقع شده اند. هدف این پژوهش بــکارگیری ایمونولــوژی محاسبه ای بـرای تعیـین شکاف های سطحی ناحیه Fab می باشد.
مواد و روشها: توالی و ساختار سوم مولکول ایمونوگلوبولینG (IgG) مرجع انسان در پایگاه داده PDB (Protein Data Bank) بدست آمدند. شکاف های سطحی ناحیه Fab-IgG توسط نرم افزارهای Profunc در پایگاه اینترنتی http://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/profunc و Isocleft finder تعیین گردیدند.
یافته ها: ده شکاف در سطح مولکول IgG توسط نرم افزار Cleft Analysis شناسایی شدند. دو تا از بزرگترین این شکاف ها در ناحیه متغیر و سومین شکاف در ناحیه ثابت Fab واقع شده اند. همچنین سه شکاف توسط نرم افزار Isocleft finder شناسایی شدند که دو تا از آنها از اشتراک دومینهای متغیر و ثابت و سومی از دومینهای ثابت ناحیه Fab تشکیل شده اند.
نتیجه گیری: شکاف های سطحی IgG شناسایی شده در این مطالعه میتوانند در تعیین اپیتوپهای مولکول IgG، ایدیوتیپهای اختصاصی و تولید آنتی بادیهای منوکلونـال اختصاصی ضد ایدیوتیپ جهت رد یابی و هدف گیری سلولهای B بدخیم، طراحی و تولید پروتئینهای مشابه برای اهداف تشخیصی و درمانی مورد استفاده قرار گیرند.
|
|
| واژه‌های کلیدی: IgG انسان، ایمونولوژی محاسبه ای، شکاف های سطحی |
|
|
متن کامل [PDF 928 kb]
(337 دریافت)
|
نوع مطالعه: پژوهشي |
موضوع مقاله:
تخصصي
دریافت: 1401/2/20 | پذیرش: 1401/4/10 | انتشار: 1401/4/10
|
|
|
|
|
|
