دانشیار، گروه میکروبشناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی البرز، کرج، ایران مرکز تحقیقات گیاهدرمانی و طب مکمل مبتنی بر شواهد، دانشگاه علوم پزشکی البرز، کرج، ایران ، firoozeh823@gmail.com
چکیده: (993 مشاهده)
مقدمه: از موضوعات مهم پژوهشها در زمینههای مولکولی و مهندسی ژنتیک، استفاده از روشهای بهینه در استخراج محتوای ژنومی میکروارگانیسمها و سلولها است که با استفاده از آن بتوان با صرف کمترین زمان و هزینه، به بیشترین مقدار و مناسبترین خلوص دستیافت. روشهای متعددی در راستای استخراج DNA باکتریها وجود دارد که از روشهای نوین جداسازی اسید نوکلئیک میتوان به استفاده از نانو ذرات مغناطیسی اشاره نمود. هدف از این مطالعه، مقایسه دو روش استخراج DNA از باکتری اشریشیا کلای با دو تکنیک فنل - کلروفرم و استفاده از نانو ذرات مغناطیسی است. روش بررسی: در این مطالعه از باکتری اشریشیا کلای سویه 25922ATCC جهت مقایسه دو روش استخراج DNA ژنومی استفاده گردید. جهت استخراج DNA ژنومی از روش فنل-کلروفرم و نیز تکنیک استفاده از نانو ذرات مغناطیسی با بکارگیری نانوذره دولایه SiO2/Fe3O4 استفاده گردید. هر دو محصول بهدستآمده جهت سنجش جذب نوری با دستگاه نانودرآپ قرائت و سپس از طریق روش الکتروفورز روی ژل آگارز بررسی گردیدند. نتایج: در بررسی میزان جذب نوری با استفاده از دستگاه نانودرآپ میزان غلظت DNA استخراجشده با روش فنل- کلروفرم 4/761 میکروگرم بر میلیلیتر و با استفاده از تکنیک استخراج با نانو ذرات مغناطیسی 531 میکروگرم بر میلیلیتر به دست آمد. نتیجهگیری: با توجه به نتایج بهدستآمده و با مقایسه جذبهای نوری دو محصول و نیز ارزیابی مقایسهای با گروههای کنترل در استخراج به روش نانو ذرات مغناطیسی و نیز با مقایسه فاکتورهای مختلفی نظیر میزان زمان موردنیاز، هزینهها، کاربری آسان میتوان نتیجه گرفت که به دلیل زمانبر و خطرآفرین بودن روش فنل - کلروفرم، روش استفاده از نانو ذرات مغناطیسی یک روش مناسب برای استخراج محتوی ژنومی است.
Amiri A, Firoozeh F, Zibaei M, Salahshoorifar I. Comparative Study of Extracted Nucleic Acid from Escherichia coli by Two Methods Phenol-chloroform and Extraction Using Magnetic Nanoparticle. aumj. 2020; 9 (3) :235-240 URL: http://aums.abzums.ac.ir/article-1-1113-fa.html
امیری آلا، فیرزوزه فرزانه، زیبایی محمد، سلحشوری فر ایمان. بررسی مقایسهای اسید نوکلئیک استخراجشده از باکتری اشریشیا کلای با دو روش استخراج با فنل-کلروفرم و تکنیک استفاده از نانو ذرات مغناطیسی. نشریه علمی پژوهشی دانشگاه علوم پزشکی البرز. 1399; 9 (3) :235-240