fa تعیین ژن های کلیدی و مسیر های پیام رسانی سلولی دخیل در بیماری زایی و ایجاد انواع تهاجمی بیماری لوسمی/لنفوم بالغین مشتق از سلول های ATLL)T) تخصصي Special پژوهشی کاربردی Original <strong><span style="font-size:12pt"><span style="line-height:150%"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span lang="FA" style="font-size:14.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" nazanin="" style="font-family:"><span style="color:black">زمینه و هدف:</span></span></span></span></span></span></span></span></span></strong><br> <span style="font-size:12pt"><span style="line-height:150%"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times="">&nbsp;<span lang="FA" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" nazanin="" style="font-family:">لوسمی/</span></span></span><span lang="AR-SA" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" nazanin="" style="font-family:">لنفوم بالغین مشتق از سلول های </span></span></span><span dir="LTR" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%">T</span></span><span lang="FA" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" nazanin="" style="font-family:"> (</span></span></span><span dir="LTR" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%">ATLL</span></span><span lang="FA" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" nazanin="" style="font-family:">) سرطانی با پیش آگهی بسیار ضعیف می باشد. </span></span></span><span dir="LTR" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%">ATLL</span></span><span lang="FA" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" nazanin="" style="font-family:"> به چهار زیر گروه حاد، مزمن، لنفوم و خاموش با پیش آگهی های بسیار متفاوت تقسیم می شود. در مطالعه حاضر سعی کردیم با استفاده از داده های بیان ژنی و روش های زیست‌ داده‌ ورزی به شناخت بهتر بیماری زایی </span></span></span><span dir="LTR" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%">ATLL</span></span><span style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" nazanin="" style="font-family:"> و تفاوت های موجود بین زیر گروه های آن بپردازیم.</span></span></span><span lang="FA" style="font-size:14.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" nazanin="" style="font-family:"><span style="color:black"></span></span></span></span></span></span></span></span></span><br> <span style="font-size:12pt"><span style="line-height:150%"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span lang="FA" style="font-size:14.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" nazanin="" style="font-family:"><span style="color:black"><strong>مواد و روش‌ها:</strong> </span></span></span></span></span></span></span></span></span><br> <span style="font-size:12pt"><span style="line-height:150%"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span lang="FA" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" nazanin="" style="font-family:"><span style="color:black">ژن های با بیان تغییر یافته در بین انواع مختلف </span></span></span></span><span dir="LTR" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%"><span style="color:black">ATLL</span></span></span><span lang="FA" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" nazanin="" style="font-family:"><span style="color:black"> مشخص شدند. با هدف تعیین ژن های کلیدی، شبکه ارتباطات پروتئینی میان ژن های حاصله ساخته شد. پس از غربال ژن های کلیدی بر اساس شاخص های مرکزیت شبکه ای، مسیر های پیام رسانی سلولی مرتبط با آنها مشخص شدند. </span></span></span></span><span dir="LTR" style="font-size:14.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" style="font-family:" titr=""><span style="color:black"></span></span></span></span></span></span></span></span></span><br> <span style="font-size:12pt"><span style="line-height:150%"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><strong>&nbsp;</strong><span lang="FA" style="font-size:14.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" nazanin="" style="font-family:"><span style="color:black"><strong>یافته‌ها:</strong> </span></span></span></span><span lang="FA" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" nazanin="" style="font-family:"><span style="color:black"></span></span></span></span></span></span></span></span></span><br> <span style="font-size:12pt"><span style="line-height:150%"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span lang="FA" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" nazanin="" style="font-family:">در مقایسه نوع حاد با انواع مزمن و خاموش، مسیر های پیام رسانی سلولی دخیل در تنظیم عملکرد دستگاه ایمنی بیان متفاوتی دارند. در مقایسه نوع حاد و مزمن با افراد سالم، ژن های مرتبط با بدخیمی درگیر هستند. در مقایسه نوع خاموش با افراد سالم، مسیر های مربوط به عفونت ها مختل شده اند. در مقایسه ثانویه نیز مشخص گردید ژن های مربوط به تکثیر سلولی و بدخیمی ها در فرم حاد بیان بالاتر و ژن های مرتبط با دستگاه ایمنی در این بیماران بیان کمتری نسبت به باقی افراد داشته اند.</span></span></span></span></span></span></span></span><br> <strong><span style="font-size:12pt"><span style="line-height:150%"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span lang="FA" style="font-size:14.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" nazanin="" style="font-family:"><span style="color:black">نتیجه‌گیری:</span></span></span></span></span></span></span></span></span></strong><br> <span style="font-size:12pt"><span style="line-height:150%"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span lang="FA" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" nazanin="" style="font-family:"><span style="color:black">به نظر می رسد دستکاری های ویروس جهت فرار از دستگاه ایمنی و همچنین تقویت تکثیر سلول های آلوده نقش تعیین کننده ای در بروز نوع تهاجمی بیماری داشته باشد. بررسی های بیشتر می تواند موجب ابداع روش های نوین تشخیصی، تعیین پیش آگهی و حتی هدف های ژن درمانی گردد</span></span></span></span><span lang="FA" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%"><span b="" nazanin="" style="font-family:"><span style="color:black">.</span></span></span></span></span></span></span></span></span> <span style="font-size:12pt"><span style="line-height:150%"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%">Background:</span></span></b><span style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%"> Adult T-cell leukemia/lymphoma (ATLL) is a cancer with a very poor prognosis. ATLL has four subgroups, acute, chronic, lymphoma, and smoldering, with very different prognoses. In this study, we tried to better understand the pathogenesis of ATLL and the differences between its subgroups by using gene expression data and bioinformatics methods.</span></span><span dir="RTL" lang="FA" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%"><span style="font-family:"B Nazanin""></span></span></span></span></span></span></span><br> <span style="font-size:12pt"><span style="line-height:150%"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%">Methods:</span></span></b><b> </b><span style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%">Genes with altered expression were identified among different types of ATLL. In order to determine the key genes, the network of protein interactions between the resulting genes was constructed. After screening the hub genes based on the network centrality indices, the cell signaling pathways related to them were identified.</span></span><span dir="RTL" lang="FA" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%"><span style="font-family:"B Nazanin""></span></span></span></span></span></span></span><br> <span style="font-size:12pt"><span style="line-height:150%"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%">Results:</span></span></b><span style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%">Comparing the acute type with the chronic and silent types, the cell signaling pathways involved in regulating the function of the immune system are expressed differently. In comparison of acute and chronic type with healthy people, genes related to malignancy are involved. In comparing the silenced type with healthy individuals, the pathways related to infections are disrupted. In the secondary comparison, it was found that the genes related to cell proliferation and malignancy in the acute form were expressed more and the genes related to the immune system were less expressed in these patients than in the rest of the population.</span></span><span dir="RTL" lang="FA" style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%"><span style="font-family:"B Nazanin""></span></span></span></span></span></span></span><br> <span style="font-size:12pt"><span style="line-height:150%"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%">Conclusion:</span></span></b><span style="font-size:13.0pt"><span style="line-height:150%">It seems that manipulations by the virus resulting in immune escape and also in increased proliferation of infected cells have a decisive role in the occurrence of the aggressive type of the disease. Further investigations can lead to the development of new diagnostic methods, determining prognosis and even the detection of targets for gene therapy.</span></span></span></span></span></span> لوسمی, لنفوم بالغین مشتق از سلول های T, ویروس انسانی لنفوتروپیک سلول T, بیوانفورماتیک,ATLL, HTLV-1 Adult T-cell leukemia/lymphoma, Human T-cell lymphotropic virus type 1, bioinformatics, ATLL, HTLV-1 88 102 http://aums.abzums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-956-2&slc_lang=fa&sid=1 Mohammad-Moien Forghani-Ramandi محمد معین فرقانی رامندی 100319475328460012261 100319475328460012261 No Student Research Committee, School of Medicine, Alborz University of Medical Sciences, Karaj, Iran دانشجوی رشته پزشکی، کمیته تحقیقات دانشجویی، دانشگاه علوم پزشکی البرز، کرج، ایران Sayed-Hamidreza Mozhgani سید حمیدرضا مژگانی 100319475328460012262 100319475328460012262 Yes Department of Microbiology and Virology, School of Medicine, Alborz University of Medical Sciences, Karaj, Iran استادیار، دانشکده پزشکی، گروه میکروب شناسی و ویروس شناسی، دانشگاه علوم پزشکی البرز، کرج، ایران